迟到扣款从哪里扣

迟到扣款应 从员工工资中扣除。具体扣除方式如下：

依据劳动合同约定：

用人单位可以根据劳动合同的约定，要求员工赔偿因迟到造成的经济损失，并从其工资中扣除相应的金额。

遵守法律规定：

根据《工资支付暂行规定》第十六条，用人单位每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

明确扣除标准：

用人单位应明确迟到的界定标准（如迟到几分钟内算迟到）和每迟到一次的扣除金额基数（通常为基本工资的一定比例，如5%至10%左右）。对于一个月内多次迟到的员工，可以采用累进扣除的方式。

透明操作：

扣除的工资应在员工当月工资中直接扣除，并在工资条中明确注明扣除的原因及金额，以确保透明度和公平性。

综上所述，迟到扣款应从员工工资中扣除，且扣除比例和方式应符合相关法律法规和用人单位内部的规章制度。